Программное обеспечение ЕГАИС предусматривает учет лесопродукции на каждой стадии движения — от лесосеки до потребителя с учетом возможных мест хранения лесоматериалов и типа применяемого транспорта. Использование единого банка данных позволит в режиме реального времени контролировать объем заготовки древесины в разрезе каждой лесосеки, цепь поставок лесоматериалов и возможность отследить происхождение древесины.